Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "",
2
  "author": "",
            
3
  "author_email": "",
3
  "author_email": "",
            
4
  "creator_user_id": "a529d3d6-d77a-4797-b965-a00f60123108",
4
  "creator_user_id": "a529d3d6-d77a-4797-b965-a00f60123108",
            
5
  "doi": "",
5
  "doi": "",
            
6
  "ext_doi": "",
6
  "ext_doi": "",
            
7
  "gen": [],
7
  "gen": [],
            
8
  "groups": [],
8
  "groups": [],
            
9
  "id": "f3fc4c1c-287c-4dae-87cf-702bad1ec485",
9
  "id": "f3fc4c1c-287c-4dae-87cf-702bad1ec485",
            
10
  "isopen": false,
10
  "isopen": false,
            
11
  "license_id": "notspecified",
11
  "license_id": "notspecified",
            
12
  "license_title": "License not specified",
12
  "license_title": "License not specified",
            
13
  "maintainer": "Youping Zhou",
13
  "maintainer": "Youping Zhou",
            
14
  "maintainer_email": "",
14
  "maintainer_email": "",
            
15
  "metadata_created": "2021-08-17T10:36:52.300672",
15
  "metadata_created": "2021-08-17T10:36:52.300672",
            
n
16
  "metadata_modified": "2021-08-17T10:37:26.499488",
n
16
  "metadata_modified": "2021-08-17T10:37:26.639169",
            
17
  "name": "intramolecular-2h-profiles",
17
  "name": "intramolecular-2h-profiles",
            
18
  "notes": "Compartmentation of C4 photosynthetic biochemistry into 
18
  "notes": "Compartmentation of C4 photosynthetic biochemistry into 
            
19
bundle sheath (BS) and mesophyll (M) cells, and photorespiration in C3 
19
bundle sheath (BS) and mesophyll (M) cells, and photorespiration in C3 
            
20
plants is predicted to have hydrogen isotopic consequences for 
20
plants is predicted to have hydrogen isotopic consequences for 
            
21
metabolites at both molecular and site-specific levels. 
21
metabolites at both molecular and site-specific levels. 
            
22
Molecular-level evidence was recently reported (Zhou et al., 2016), 
22
Molecular-level evidence was recently reported (Zhou et al., 2016), 
            
23
but evidence at the site-specific level is still lacking. We propose 
23
but evidence at the site-specific level is still lacking. We propose 
            
24
that such evidence exists in the contrasting 2H distribution profiles 
24
that such evidence exists in the contrasting 2H distribution profiles 
            
25
of glucose samples from naturally grown C3, C4 and CAM plants: 
25
of glucose samples from naturally grown C3, C4 and CAM plants: 
            
26
photorespiration contributes to the relative 2H enrichment in H5 and 
26
photorespiration contributes to the relative 2H enrichment in H5 and 
            
27
relative 2H depletion in H1 & H6 (the average of the two pro-chiral Hs 
27
relative 2H depletion in H1 & H6 (the average of the two pro-chiral Hs 
            
28
and in particular H6, pro-R) in C3 glucose, while 2H-enriched C3 
28
and in particular H6, pro-R) in C3 glucose, while 2H-enriched C3 
            
29
mesophyll cellular (chloroplastic) water most likely contributes to 
29
mesophyll cellular (chloroplastic) water most likely contributes to 
            
30
the enrichment at H4; export of (transferable hydrogen atoms of) NADPH 
30
the enrichment at H4; export of (transferable hydrogen atoms of) NADPH 
            
31
from C4 mesophyll cells to bundle sheath cells (via the malate 
31
from C4 mesophyll cells to bundle sheath cells (via the malate 
            
32
shuttle) and incorporation of 2H-relatively unenriched BS cellular 
32
shuttle) and incorporation of 2H-relatively unenriched BS cellular 
            
33
water contribute to the relative depletion of H4 & H5 respectively; 
33
water contribute to the relative depletion of H4 & H5 respectively; 
            
34
shuttling of triose-phosphates (PGA: phosphoglycerate dand DHAP: 
34
shuttling of triose-phosphates (PGA: phosphoglycerate dand DHAP: 
            
35
dihydroacetone phosphate) between C4 bundle sheath and mesophyll cells 
35
dihydroacetone phosphate) between C4 bundle sheath and mesophyll cells 
            
36
contributes to the relative enrichment in H1 & H6 (in particular H6, 
36
contributes to the relative enrichment in H1 & H6 (in particular H6, 
            
37
pro-R) in C4 glucose.",
37
pro-R) in C4 glucose.",
            
38
  "num_resources": 1,
38
  "num_resources": 1,
            
39
  "num_tags": 3,
39
  "num_tags": 3,
            
40
  "organization": {
40
  "organization": {
            
41
    "approval_status": "approved",
41
    "approval_status": "approved",
            
42
    "created": "2021-08-17T10:32:20.184796",
42
    "created": "2021-08-17T10:32:20.184796",
            
43
    "description": "LWCD: Leaf wax (C and H) and cellulose (O) 
43
    "description": "LWCD: Leaf wax (C and H) and cellulose (O) 
            
44
Database is develloped by an active research group that focuses on 
44
Database is develloped by an active research group that focuses on 
            
45
employing compound-specific and position-specific H/C/O isotope 
45
employing compound-specific and position-specific H/C/O isotope 
            
46
signals at natural abundance level to understand plant metabolism and 
46
signals at natural abundance level to understand plant metabolism and 
            
47
physiology. This research is leading to the development of an isotope 
47
physiology. This research is leading to the development of an isotope 
            
48
database for leaf lipids, amino acids and \uf061-cellulose and soluble 
48
database for leaf lipids, amino acids and \uf061-cellulose and soluble 
            
49
sugars. Currently the database is composed of carbon and hidrogen 
49
sugars. Currently the database is composed of carbon and hidrogen 
            
50
isotope data for lipids synthesized via three independent biosynthetic 
50
isotope data for lipids synthesized via three independent biosynthetic 
            
51
pathways for over 100 species of tropical grasses and 6 species of 
51
pathways for over 100 species of tropical grasses and 6 species of 
            
52
controlled grown plants and oxygen isotope data from cellulose for 
52
controlled grown plants and oxygen isotope data from cellulose for 
            
53
more than 200 species across temperate, subtropical and tropic zones. 
53
more than 200 species across temperate, subtropical and tropic zones. 
            
54
",
54
",
            
55
    "id": "5a9ebe33-8bc7-45e6-8aa2-0f4779fe984d",
55
    "id": "5a9ebe33-8bc7-45e6-8aa2-0f4779fe984d",
            
56
    "image_url": 
56
    "image_url": 
            
57
"2021-08-17-103220.1724251-s2.0-S0031942217303515-fx1.jpg",
57
"2021-08-17-103220.1724251-s2.0-S0031942217303515-fx1.jpg",
            
58
    "is_organization": true,
58
    "is_organization": true,
            
59
    "name": "lwcd",
59
    "name": "lwcd",
            
60
    "state": "active",
60
    "state": "active",
            
61
    "title": "LWCD",
61
    "title": "LWCD",
            
62
    "type": "organization"
62
    "type": "organization"
            
63
  },
63
  },
            
64
  "owner_org": "5a9ebe33-8bc7-45e6-8aa2-0f4779fe984d",
64
  "owner_org": "5a9ebe33-8bc7-45e6-8aa2-0f4779fe984d",
            
65
  "private": false,
65
  "private": false,
            
66
  "relationships_as_object": [],
66
  "relationships_as_object": [],
            
67
  "relationships_as_subject": [],
67
  "relationships_as_subject": [],
            
68
  "resources": [
68
  "resources": [
            
69
    {
69
    {
            
70
      "cache_last_updated": null,
70
      "cache_last_updated": null,
            
71
      "cache_url": null,
71
      "cache_url": null,
            
72
      "created": "2021-08-17T10:37:26.511253",
72
      "created": "2021-08-17T10:37:26.511253",
            
73
      "datastore_active": false,
73
      "datastore_active": false,
            
74
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
74
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
75
      "description": "    Provides a biochemical explanation for the 
75
      "description": "    Provides a biochemical explanation for the 
            
76
observed contrasting intramolecular 2H distribution profiles of C3 and 
76
observed contrasting intramolecular 2H distribution profiles of C3 and 
            
77
C4 glucoses.\r\n\u2022\r\n\r\n    Photorespiration contributes to the 
77
C4 glucoses.\r\n\u2022\r\n\r\n    Photorespiration contributes to the 
            
78
relative 2H enrichment in C4-H & C5-H and depletion in C1-H & C6-H in 
78
relative 2H enrichment in C4-H & C5-H and depletion in C1-H & C6-H in 
            
79
C3 glucose.\r\n\u2022\r\n\r\n    Mesophyll (M)-to-bundle shealth (BS) 
79
C3 glucose.\r\n\u2022\r\n\r\n    Mesophyll (M)-to-bundle shealth (BS) 
            
80
cell export of NADPH contributes to the relative depletion of C4-H & 
80
cell export of NADPH contributes to the relative depletion of C4-H & 
            
81
C5-H in C4 glucose.\r\n\u2022\r\n\r\n    Triose-phosphates shuttling 
81
C5-H in C4 glucose.\r\n\u2022\r\n\r\n    Triose-phosphates shuttling 
            
82
between M & BS cells contribute to the relative enrichment in C1-H & 
82
between M & BS cells contribute to the relative enrichment in C1-H & 
            
83
C6-H in C4 glucose.",
83
C6-H in C4 glucose.",
            
84
      "format": "",
84
      "format": "",
            
85
      "hash": "",
85
      "hash": "",
            
86
      "id": "d1ae89cc-978f-48d2-a302-016ca8a59f63",
86
      "id": "d1ae89cc-978f-48d2-a302-016ca8a59f63",
            
87
      "last_modified": null,
87
      "last_modified": null,
            
n
88
      "metadata_modified": "2021-08-17T10:37:26.502772",
n
88
      "metadata_modified": "2021-08-17T10:37:26.642941",
            
89
      "mimetype": null,
89
      "mimetype": null,
            
90
      "mimetype_inner": null,
90
      "mimetype_inner": null,
            
91
      "name": "Article on H2 profiles",
91
      "name": "Article on H2 profiles",
            
92
      "package_id": "f3fc4c1c-287c-4dae-87cf-702bad1ec485",
92
      "package_id": "f3fc4c1c-287c-4dae-87cf-702bad1ec485",
            
93
      "position": 0,
93
      "position": 0,
            
94
      "resource_type": null,
94
      "resource_type": null,
            
95
      "size": null,
95
      "size": null,
            
96
      "state": "active",
96
      "state": "active",
            
97
      "url": 
97
      "url": 
            
98
ps://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0031942217303515",
98
ps://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0031942217303515",
            
99
      "url_type": null
99
      "url_type": null
            
100
    }
100
    }
            
101
  ],
101
  ],
            
102
  "spatial": "",
102
  "spatial": "",
            
t
103
  "state": "draft",
t
103
  "state": "active",
            
104
  "tags": [
104
  "tags": [
            
105
    {
105
    {
            
106
      "display_name": "Leaf waxes",
106
      "display_name": "Leaf waxes",
            
107
      "id": "1971a77b-e809-465f-ab8c-7739a23e5394",
107
      "id": "1971a77b-e809-465f-ab8c-7739a23e5394",
            
108
      "name": "Leaf waxes",
108
      "name": "Leaf waxes",
            
109
      "state": "active",
109
      "state": "active",
            
110
      "vocabulary_id": null
110
      "vocabulary_id": null
            
111
    },
111
    },
            
112
    {
112
    {
            
113
      "display_name": "hydrogen isotopes",
113
      "display_name": "hydrogen isotopes",
            
114
      "id": "61406088-f6a2-450e-bc59-1394d91e6e8e",
114
      "id": "61406088-f6a2-450e-bc59-1394d91e6e8e",
            
115
      "name": "hydrogen isotopes",
115
      "name": "hydrogen isotopes",
            
116
      "state": "active",
116
      "state": "active",
            
117
      "vocabulary_id": null
117
      "vocabulary_id": null
            
118
    },
118
    },
            
119
    {
119
    {
            
120
      "display_name": "stable isotopes",
120
      "display_name": "stable isotopes",
            
121
      "id": "90bb4928-f076-4d9b-9998-98529e2a79d5",
121
      "id": "90bb4928-f076-4d9b-9998-98529e2a79d5",
            
122
      "name": "stable isotopes",
122
      "name": "stable isotopes",
            
123
      "state": "active",
123
      "state": "active",
            
124
      "vocabulary_id": null
124
      "vocabulary_id": null
            
125
    }
125
    }
            
126
  ],
126
  ],
            
127
  "temporal_end": "",
127
  "temporal_end": "",
            
128
  "temporal_start": "",
128
  "temporal_start": "",
            
129
  "title": "Intramolecular 2H profiles",
129
  "title": "Intramolecular 2H profiles",
            
130
  "type": "dataset",
130
  "type": "dataset",
            
131
  "url": null,
131
  "url": null,
            
132
  "version": ""
132
  "version": ""
            
133
}
133
}