Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Mark Hudson & Ricardo Fernandes",
2
  "author": "Mark Hudson & Ricardo Fernandes",
            
3
  "author_email": "hudson@shh.mpg.de",
3
  "author_email": "hudson@shh.mpg.de",
            
4
  "creator_user_id": "a529d3d6-d77a-4797-b965-a00f60123108",
4
  "creator_user_id": "a529d3d6-d77a-4797-b965-a00f60123108",
            
5
  "doi": "10.48493/jyvf-5a27",
5
  "doi": "10.48493/jyvf-5a27",
            
6
  "ext_doi": "",
6
  "ext_doi": "",
            
7
  "gen": [
7
  "gen": [
            
8
    "yes"
8
    "yes"
            
9
  ],
9
  ],
            
10
  "groups": [
10
  "groups": [
            
11
    {
11
    {
            
12
      "description": "The IsoMemo group list datasets created by 
12
      "description": "The IsoMemo group list datasets created by 
            
13
IsoMemo partners. Both those that are stored internally within Pandora 
13
IsoMemo partners. Both those that are stored internally within Pandora 
            
14
and those that are stored externally.",
14
and those that are stored externally.",
            
15
      "display_name": "IsoMemo group",
15
      "display_name": "IsoMemo group",
            
16
      "id": "1739bd12-4cd3-48eb-8658-c1d470d0f965",
16
      "id": "1739bd12-4cd3-48eb-8658-c1d470d0f965",
            
17
      "image_display_url": 
17
      "image_display_url": 
            
18
s://pandoradata.earth/uploads/group/2021-03-30-175014.746487logo.jpg",
18
s://pandoradata.earth/uploads/group/2021-03-30-175014.746487logo.jpg",
            
19
      "name": "isomemo-group",
19
      "name": "isomemo-group",
            
20
      "title": "IsoMemo group"
20
      "title": "IsoMemo group"
            
21
    }
21
    }
            
22
  ],
22
  ],
            
23
  "id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
23
  "id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
24
  "isopen": true,
24
  "isopen": true,
            
25
  "license_id": "cc-by-sa",
25
  "license_id": "cc-by-sa",
            
26
  "license_title": "Creative Commons Attribution Share-Alike",
26
  "license_title": "Creative Commons Attribution Share-Alike",
            
27
  "license_url": "http://www.opendefinition.org/licenses/cc-by-sa",
27
  "license_url": "http://www.opendefinition.org/licenses/cc-by-sa",
            
28
  "maintainer": "Mark Hudson",
28
  "maintainer": "Mark Hudson",
            
29
  "maintainer_email": "hudson@shh.mpg.de",
29
  "maintainer_email": "hudson@shh.mpg.de",
            
30
  "metadata_created": "2021-02-24T14:13:23.047617",
30
  "metadata_created": "2021-02-24T14:13:23.047617",
            
n
31
  "metadata_modified": "2021-05-31T16:54:33.693551",
n
31
  "metadata_modified": "2021-06-11T13:13:02.738948",
            
32
  "name": "archipelago-human-stable-isotope-database",
32
  "name": "archipelago-human-stable-isotope-database",
            
33
  "notes": "The dataset contains human bone and hair carbon and 
33
  "notes": "The dataset contains human bone and hair carbon and 
            
34
nitrogen stable isotopes measurements from Japanese archaeological 
34
nitrogen stable isotopes measurements from Japanese archaeological 
            
35
sites covering the time span from the Upper Palaeolithic to the 
35
sites covering the time span from the Upper Palaeolithic to the 
            
36
mid-nineteenth century. ",
36
mid-nineteenth century. ",
            
37
  "num_resources": 6,
37
  "num_resources": 6,
            
38
  "num_tags": 5,
38
  "num_tags": 5,
            
39
  "organization": {
39
  "organization": {
            
40
    "approval_status": "approved",
40
    "approval_status": "approved",
            
41
    "created": "2021-02-03T17:53:29.162864",
41
    "created": "2021-02-03T17:53:29.162864",
            
42
    "description": "ARCHIPELAGO is an integrated archaeological and 
42
    "description": "ARCHIPELAGO is an integrated archaeological and 
            
43
historical database of land and sea resources utilised by humans in 
43
historical database of land and sea resources utilised by humans in 
            
44
the Japanese Islands. ",
44
the Japanese Islands. ",
            
45
    "id": "bbef4dd3-7e14-4de7-925e-8b2343542130",
45
    "id": "bbef4dd3-7e14-4de7-925e-8b2343542130",
            
46
    "image_url": "2021-02-21-190437.479608logo.png",
46
    "image_url": "2021-02-21-190437.479608logo.png",
            
47
    "is_organization": true,
47
    "is_organization": true,
            
48
    "name": "archipelago",
48
    "name": "archipelago",
            
49
    "state": "active",
49
    "state": "active",
            
50
    "title": "ARCHIPELAGO",
50
    "title": "ARCHIPELAGO",
            
51
    "type": "organization"
51
    "type": "organization"
            
52
  },
52
  },
            
53
  "owner_org": "bbef4dd3-7e14-4de7-925e-8b2343542130",
53
  "owner_org": "bbef4dd3-7e14-4de7-925e-8b2343542130",
            
54
  "private": false,
54
  "private": false,
            
55
  "relationships_as_object": [],
55
  "relationships_as_object": [],
            
56
  "relationships_as_subject": [],
56
  "relationships_as_subject": [],
            
57
  "resources": [
57
  "resources": [
            
58
    {
58
    {
            
59
      "cache_last_updated": null,
59
      "cache_last_updated": null,
            
60
      "cache_url": null,
60
      "cache_url": null,
            
61
      "created": "2021-02-24T22:09:19.603156",
61
      "created": "2021-02-24T22:09:19.603156",
            
62
      "description": "The data table consists of fields organized into 
62
      "description": "The data table consists of fields organized into 
            
63
thematic groups. Each data entry is identified by a unique sequential 
63
thematic groups. Each data entry is identified by a unique sequential 
            
64
key (Entry ID). The data submitter may include additional comments not 
64
key (Entry ID). The data submitter may include additional comments not 
            
65
covered by the existing fields (Comments), and identify the data 
65
covered by the existing fields (Comments), and identify the data 
            
66
submitter (ID submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample 
66
submitter (ID submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample 
            
67
context are described in several fields. A site name (Site name), 
67
context are described in several fields. A site name (Site name), 
            
68
short site description (Site description), short description of burial 
68
short site description (Site description), short description of burial 
            
69
context (Context description), a context identifier as given in 
69
context (Context description), a context identifier as given in 
            
70
publication (Context ID), the name of the locality at which the site 
70
publication (Context ID), the name of the locality at which the site 
            
71
is located (Locality), of the corresponding region (Region), the site 
71
is located (Locality), of the corresponding region (Region), the site 
            
72
altitude in meters (Altitude), latitude (Latitude) and longitude 
72
altitude in meters (Altitude), latitude (Latitude) and longitude 
            
73
(Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether the location 
73
(Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether the location 
            
74
of a site could not be exactly established (Exact) and if not the 
74
of a site could not be exactly established (Exact) and if not the 
            
75
range in kilometres within it is expected to be located relative to 
75
range in kilometres within it is expected to be located relative to 
            
76
the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological individual 
76
the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological individual 
            
77
from which the sample was taken is identified using the identification 
77
from which the sample was taken is identified using the identification 
            
78
provided in the original publication (Individual ID) followed by a 
78
provided in the original publication (Individual ID) followed by a 
            
79
short description of the burial (Burial type). Additional sample 
79
short description of the burial (Burial type). Additional sample 
            
80
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
80
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
            
81
common language (Taxon common name). Our database currently contains 
81
common language (Taxon common name). Our database currently contains 
            
82
only human data but in the future we plan to expand it to include 
82
only human data but in the future we plan to expand it to include 
            
83
other taxa. Osteological information includes sex identification 
83
other taxa. Osteological information includes sex identification 
            
84
(Sex), a text description of age (Age category individual), numeric 
84
(Sex), a text description of age (Age category individual), numeric 
            
85
ranges in years for minimum (Min. age individual) and maximum age 
85
ranges in years for minimum (Min. age individual) and maximum age 
            
86
(Max. age individual), and the type of bone or hair material that 
86
(Max. age individual), and the type of bone or hair material that 
            
87
sampled from the archaeological individual (sample type).\r\n\r\nThe 
87
sampled from the archaeological individual (sample type).\r\n\r\nThe 
            
88
chronological range of the sample is given by a minimum age (Min age 
88
chronological range of the sample is given by a minimum age (Min age 
            
89
(95%)) and maximum age (Max age (95%)) in years BC and AD with years 
89
(95%)) and maximum age (Max age (95%)) in years BC and AD with years 
            
90
BC expressed by negative numbers. Age assignment followed a 
90
BC expressed by negative numbers. Age assignment followed a 
            
91
hierarchical approach. Whenever available we employed direct dates 
91
hierarchical approach. Whenever available we employed direct dates 
            
92
from samples (e.g. radiocarbon dates, in which the calibrated 95% 
92
from samples (e.g. radiocarbon dates, in which the calibrated 95% 
            
93
range is reported) or from coeval samples from the same archaeological 
93
range is reported) or from coeval samples from the same archaeological 
            
94
context. If necessary, corrections for aquatic radiocarbon reservoir 
94
context. If necessary, corrections for aquatic radiocarbon reservoir 
            
95
effects were applied. If no secure dating was available from the 
95
effects were applied. If no secure dating was available from the 
            
96
sample context, we employed the site\u2019s chronology given usually 
96
sample context, we employed the site\u2019s chronology given usually 
            
97
in the archaeological report. If this was also not available, we 
97
in the archaeological report. If this was also not available, we 
            
98
employed the full cultural range to which the sample was assigned. A 
98
employed the full cultural range to which the sample was assigned. A 
            
99
field was used to identify the type of employed dating method (Dating 
99
field was used to identify the type of employed dating method (Dating 
            
100
method). Also included were fields for uncalibrated direct radiocarbon 
100
method). Also included were fields for uncalibrated direct radiocarbon 
            
101
dates on sample (14C), its uncertainty (14C unc). Period tags are also 
101
dates on sample (14C), its uncertainty (14C unc). Period tags are also 
            
102
used to provide traditional chronological information (Period 
102
used to provide traditional chronological information (Period 
            
103
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta 13C coll) and 
103
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta 13C coll) and 
            
104
nitrogen (delta 15N coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
104
nitrogen (delta 15N coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
            
105
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
105
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
            
106
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
106
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
            
107
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
107
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
            
108
collagen yield for bone samples (Collagen yield).\r\n\r\nA reference 
108
collagen yield for bone samples (Collagen yield).\r\n\r\nA reference 
            
109
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
109
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
            
110
source publication or publications from where the data was collected 
110
source publication or publications from where the data was collected 
            
111
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
111
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
            
112
available (Link), a DOI (DOI), and the publication date or dates 
112
available (Link), a DOI (DOI), and the publication date or dates 
            
113
(Publication date). Macrons were not used for Japanese titles in the 
113
(Publication date). Macrons were not used for Japanese titles in the 
            
114
list.\r\n",
114
list.\r\n",
            
115
      "format": "CSV",
115
      "format": "CSV",
            
116
      "hash": "",
116
      "hash": "",
            
117
      "id": "971c397a-1806-4b59-97e1-0915dab25428",
117
      "id": "971c397a-1806-4b59-97e1-0915dab25428",
            
118
      "last_modified": "2021-02-25T12:00:37.011370",
118
      "last_modified": "2021-02-25T12:00:37.011370",
            
119
      "metadata_modified": "2021-02-25T12:00:37.022584",
119
      "metadata_modified": "2021-02-25T12:00:37.022584",
            
120
      "mimetype": "text/csv",
120
      "mimetype": "text/csv",
            
121
      "mimetype_inner": null,
121
      "mimetype_inner": null,
            
122
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
122
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
            
123
in Japan",
123
in Japan",
            
124
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
124
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
125
      "position": 0,
125
      "position": 0,
            
126
      "resource_type": null,
126
      "resource_type": null,
            
127
      "size": 799850,
127
      "size": 799850,
            
128
      "state": "active",
128
      "state": "active",
            
129
      "url": 
129
      "url": 
            
130
71c397a-1806-4b59-97e1-0915dab25428/download/japan-human-si-data.csv",
130
71c397a-1806-4b59-97e1-0915dab25428/download/japan-human-si-data.csv",
            
131
      "url_type": "upload"
131
      "url_type": "upload"
            
132
    },
132
    },
            
133
    {
133
    {
            
134
      "cache_last_updated": null,
134
      "cache_last_updated": null,
            
135
      "cache_url": null,
135
      "cache_url": null,
            
136
      "created": "2021-05-26T18:05:45.096083",
136
      "created": "2021-05-26T18:05:45.096083",
            
137
      "description": "Version 2 (Excel format) of database for stable 
137
      "description": "Version 2 (Excel format) of database for stable 
            
138
isotope measurements for archaeological humans in Japan\r\n\r\nThe 
138
isotope measurements for archaeological humans in Japan\r\n\r\nThe 
            
139
data table consists of fields organized into thematic groups. Each 
139
data table consists of fields organized into thematic groups. Each 
            
140
data entry is identified by a unique sequential key (Entry_ ID). The 
140
data entry is identified by a unique sequential key (Entry_ ID). The 
            
141
data submitter may include additional comments not covered by the 
141
data submitter may include additional comments not covered by the 
            
142
existing fields (Comments), and identify the data submitter by name 
142
existing fields (Comments), and identify the data submitter by name 
            
143
(ID_ submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample context are 
143
(ID_ submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample context are 
            
144
described in several fields. A site name (Site name), short site 
144
described in several fields. A site name (Site name), short site 
            
145
description of the type of site (Site_ description), short description 
145
description of the type of site (Site_ description), short description 
            
146
of burial context (Context description), a context identifier as given 
146
of burial context (Context description), a context identifier as given 
            
147
in original publication (Context_ ID), the name of the locality at 
147
in original publication (Context_ ID), the name of the locality at 
            
148
which the site is located (Locality), of the corresponding region 
148
which the site is located (Locality), of the corresponding region 
            
149
(Region), the site altitude in meteres (Altitude), latitude (Latitude) 
149
(Region), the site altitude in meteres (Altitude), latitude (Latitude) 
            
150
and longitude (Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether 
150
and longitude (Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether 
            
151
the location of a site could not be exactly established (Exact) and if 
151
the location of a site could not be exactly established (Exact) and if 
            
152
not the range in kilometres within it is expected to be located 
152
not the range in kilometres within it is expected to be located 
            
153
relative to the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological 
153
relative to the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological 
            
154
individual from which the sample was taken is identified using the 
154
individual from which the sample was taken is identified using the 
            
155
identification provided in the original publication (Individual ID) 
155
identification provided in the original publication (Individual ID) 
            
156
followed by a short description of the burial 
156
followed by a short description of the burial 
            
157
(Burial_type_skeletal_context Burial type). Additional sample 
157
(Burial_type_skeletal_context Burial type). Additional sample 
            
158
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
158
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
            
159
common language (Taxon common name). Our database dataset currently 
159
common language (Taxon common name). Our database dataset currently 
            
160
contains only human data but in the future we plan to expand it to 
160
contains only human data but in the future we plan to expand it to 
            
161
include other taxa. Osteological information includes sex 
161
include other taxa. Osteological information includes sex 
            
162
identification (Sex), a text description of age (Age_ category_ 
162
identification (Sex), a text description of age (Age_ category_ 
            
163
individual), numeric ranges in years for minimum (Min_. age_ 
163
individual), numeric ranges in years for minimum (Min_. age_ 
            
164
individual) and maximum age (Max_. age_ individual) biological age of 
164
individual) and maximum age (Max_. age_ individual) biological age of 
            
165
the individual at death, and the type of bone or hair material that 
165
the individual at death, and the type of bone or hair material that 
            
166
sampled from the archaeological individual (Ssample_ 
166
sampled from the archaeological individual (Ssample_ 
            
167
type).\r\n\r\nBiological age categories for skeletal individuals 
167
type).\r\n\r\nBiological age categories for skeletal individuals 
            
168
followed the published reports. These reports used standard 
168
followed the published reports. These reports used standard 
            
169
bioarchaeological categories based on dental and skeletal age [24]: 
169
bioarchaeological categories based on dental and skeletal age [24]: 
            
170
infant: birth \u2013 3 years; child: 3- 12 years; adolescent: 12-20 
170
infant: birth \u2013 3 years; child: 3- 12 years; adolescent: 12-20 
            
171
years; young adult: 20-35 years; middle adult: 35-50 years; old adult: 
171
years; young adult: 20-35 years; middle adult: 35-50 years; old adult: 
            
172
50 + years. In some cases, particularly with older publications, the 
172
50 + years. In some cases, particularly with older publications, the 
            
173
ages of these categories may differ slightly. The age > 55 is 
173
ages of these categories may differ slightly. The age > 55 is 
            
174
sometimes used for \u2018older adults\u2019 in the Japanese 
174
sometimes used for \u2018older adults\u2019 in the Japanese 
            
175
literature. Cases where the same values are reported for minimum and 
175
literature. Cases where the same values are reported for minimum and 
            
176
maximum individual ages represent average estimated age. Some of the 
176
maximum individual ages represent average estimated age. Some of the 
            
177
studies used here report very precise age estimates for sub-adults. In 
177
studies used here report very precise age estimates for sub-adults. In 
            
178
such cases our dataset follows these estimates, which are derived from 
178
such cases our dataset follows these estimates, which are derived from 
            
179
different methods described in the studies concerned.\r\n\r\nThe 
179
different methods described in the studies concerned.\r\n\r\nThe 
            
180
chronological range of the sample is given by a minimum age 
180
chronological range of the sample is given by a minimum age 
            
181
(Min_chronology age (95%)) and maximum age (Max_chronology age (95%)) 
181
(Min_chronology age (95%)) and maximum age (Max_chronology age (95%)) 
            
182
in years BC and AD with years BC expressed by negative numbers. Age 
182
in years BC and AD with years BC expressed by negative numbers. Age 
            
183
assignment followed a hierarchical approach. Whenever available we 
183
assignment followed a hierarchical approach. Whenever available we 
            
184
employed direct dates from samples (e.g. radiocarbon dates, in which 
184
employed direct dates from samples (e.g. radiocarbon dates, in which 
            
185
the calibrated 95% range is reported) or from coeval samples from the 
185
the calibrated 95% range is reported) or from coeval samples from the 
            
186
same archaeological context. If necessary, corrections for aquatic 
186
same archaeological context. If necessary, corrections for aquatic 
            
187
marine radiocarbon reservoir effects were applied on direct 
187
marine radiocarbon reservoir effects were applied on direct 
            
188
radiocarbon measurements of human bones (see below). A dataset field 
188
radiocarbon measurements of human bones (see below). A dataset field 
            
189
(Dietary_ model_selection) identifies the type of Bayesian model 
189
(Dietary_ model_selection) identifies the type of Bayesian model 
            
190
employed to estimate the dietary contributions from marine carbon.. If 
190
employed to estimate the dietary contributions from marine carbon.. If 
            
191
no secure dating was available from the sample context, we employed 
191
no secure dating was available from the sample context, we employed 
            
192
the site\u2019s chronology given usually in the archaeological report. 
192
the site\u2019s chronology given usually in the archaeological report. 
            
193
If this was also not available, we employed the full cultural range to 
193
If this was also not available, we employed the full cultural range to 
            
194
which the sample was assigned. A field was used to identify the type 
194
which the sample was assigned. A field was used to identify the type 
            
195
of employed dating method (Dating_ method). Also included were fields 
195
of employed dating method (Dating_ method). Also included were fields 
            
196
for uncalibrated direct radiocarbon dates on sample (14C), its 
196
for uncalibrated direct radiocarbon dates on sample (14C), its 
            
197
uncertainty (14C unc). Period tags are also used to provide 
197
uncertainty (14C unc). Period tags are also used to provide 
            
198
traditional chronological information (Period_ 
198
traditional chronological information (Period_ 
            
199
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta_ 13C_ coll) and 
199
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta_ 13C_ coll) and 
            
200
nitrogen (delta_ 15N_ coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
200
nitrogen (delta_ 15N_ coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
            
201
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
201
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
            
202
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
202
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
            
203
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
203
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
            
204
collagen yield for bone samples (Collagen_ yield).\r\n\r\nA reference 
204
collagen yield for bone samples (Collagen_ yield).\r\n\r\nA reference 
            
205
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
205
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
            
206
source publication or publications from where the data was collected 
206
source publication or publications from where the data was collected 
            
207
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
207
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
            
208
available (Link), a Digital object identifier as a persistent 
208
available (Link), a Digital object identifier as a persistent 
            
209
identifier DOI (DOI), and the publication date or dates (Publication_ 
209
identifier DOI (DOI), and the publication date or dates (Publication_ 
            
210
date). Macrons were not used for Japanese titles in the list.",
210
date). Macrons were not used for Japanese titles in the list.",
            
211
      "format": "XLSX",
211
      "format": "XLSX",
            
212
      "hash": "",
212
      "hash": "",
            
213
      "id": "b147d214-b60f-4bb4-af6c-5bde3eefffeb",
213
      "id": "b147d214-b60f-4bb4-af6c-5bde3eefffeb",
            
214
      "last_modified": "2021-05-26T18:05:45.042633",
214
      "last_modified": "2021-05-26T18:05:45.042633",
            
215
      "metadata_modified": "2021-05-31T16:28:40.221594",
215
      "metadata_modified": "2021-05-31T16:28:40.221594",
            
216
      "mimetype": 
216
      "mimetype": 
            
217
"application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet",
217
"application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet",
            
218
      "mimetype_inner": null,
218
      "mimetype_inner": null,
            
219
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
219
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
            
220
in Japan v. 2 (Excel)",
220
in Japan v. 2 (Excel)",
            
221
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
221
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
222
      "position": 1,
222
      "position": 1,
            
223
      "resource_type": null,
223
      "resource_type": null,
            
224
      "size": 280177,
224
      "size": 280177,
            
225
      "state": "active",
225
      "state": "active",
            
226
      "url": 
226
      "url": 
            
227
214-b60f-4bb4-af6c-5bde3eefffeb/download/japan-human-si-data-v2.xlsx",
227
214-b60f-4bb4-af6c-5bde3eefffeb/download/japan-human-si-data-v2.xlsx",
            
228
      "url_type": "upload"
228
      "url_type": "upload"
            
229
    },
229
    },
            
230
    {
230
    {
            
231
      "cache_last_updated": null,
231
      "cache_last_updated": null,
            
232
      "cache_url": null,
232
      "cache_url": null,
            
233
      "created": "2021-05-31T16:28:37.185134",
233
      "created": "2021-05-31T16:28:37.185134",
            
234
      "description": "Version 2 (CSV format) of database for stable 
234
      "description": "Version 2 (CSV format) of database for stable 
            
235
isotope measurements for archaeological humans in Japan\r\n\r\nThe 
235
isotope measurements for archaeological humans in Japan\r\n\r\nThe 
            
236
data table consists of fields organized into thematic groups. Each 
236
data table consists of fields organized into thematic groups. Each 
            
237
data entry is identified by a unique sequential key (Entry_ ID). The 
237
data entry is identified by a unique sequential key (Entry_ ID). The 
            
238
data submitter may include additional comments not covered by the 
238
data submitter may include additional comments not covered by the 
            
239
existing fields (Comments), and identify the data submitter by name 
239
existing fields (Comments), and identify the data submitter by name 
            
240
(ID_ submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample context are 
240
(ID_ submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample context are 
            
241
described in several fields. A site name (Site name), short site 
241
described in several fields. A site name (Site name), short site 
            
242
description of the type of site (Site_ description), short description 
242
description of the type of site (Site_ description), short description 
            
243
of burial context (Context description), a context identifier as given 
243
of burial context (Context description), a context identifier as given 
            
244
in original publication (Context_ ID), the name of the locality at 
244
in original publication (Context_ ID), the name of the locality at 
            
245
which the site is located (Locality), of the corresponding region 
245
which the site is located (Locality), of the corresponding region 
            
246
(Region), the site altitude in meteres (Altitude), latitude (Latitude) 
246
(Region), the site altitude in meteres (Altitude), latitude (Latitude) 
            
247
and longitude (Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether 
247
and longitude (Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether 
            
248
the location of a site could not be exactly established (Exact) and if 
248
the location of a site could not be exactly established (Exact) and if 
            
249
not the range in kilometres within it is expected to be located 
249
not the range in kilometres within it is expected to be located 
            
250
relative to the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological 
250
relative to the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological 
            
251
individual from which the sample was taken is identified using the 
251
individual from which the sample was taken is identified using the 
            
252
identification provided in the original publication (Individual ID) 
252
identification provided in the original publication (Individual ID) 
            
253
followed by a short description of the burial 
253
followed by a short description of the burial 
            
254
(Burial_type_skeletal_context Burial type). Additional sample 
254
(Burial_type_skeletal_context Burial type). Additional sample 
            
255
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
255
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
            
256
common language (Taxon common name). Our database dataset currently 
256
common language (Taxon common name). Our database dataset currently 
            
257
contains only human data but in the future we plan to expand it to 
257
contains only human data but in the future we plan to expand it to 
            
258
include other taxa. Osteological information includes sex 
258
include other taxa. Osteological information includes sex 
            
259
identification (Sex), a text description of age (Age_ category_ 
259
identification (Sex), a text description of age (Age_ category_ 
            
260
individual), numeric ranges in years for minimum (Min_. age_ 
260
individual), numeric ranges in years for minimum (Min_. age_ 
            
261
individual) and maximum age (Max_. age_ individual) biological age of 
261
individual) and maximum age (Max_. age_ individual) biological age of 
            
262
the individual at death, and the type of bone or hair material that 
262
the individual at death, and the type of bone or hair material that 
            
263
sampled from the archaeological individual (Ssample_ 
263
sampled from the archaeological individual (Ssample_ 
            
264
type).\r\n\r\nBiological age categories for skeletal individuals 
264
type).\r\n\r\nBiological age categories for skeletal individuals 
            
265
followed the published reports. These reports used standard 
265
followed the published reports. These reports used standard 
            
266
bioarchaeological categories based on dental and skeletal age [24]: 
266
bioarchaeological categories based on dental and skeletal age [24]: 
            
267
infant: birth \u2013 3 years; child: 3- 12 years; adolescent: 12-20 
267
infant: birth \u2013 3 years; child: 3- 12 years; adolescent: 12-20 
            
268
years; young adult: 20-35 years; middle adult: 35-50 years; old adult: 
268
years; young adult: 20-35 years; middle adult: 35-50 years; old adult: 
            
269
50 + years. In some cases, particularly with older publications, the 
269
50 + years. In some cases, particularly with older publications, the 
            
270
ages of these categories may differ slightly. The age > 55 is 
270
ages of these categories may differ slightly. The age > 55 is 
            
271
sometimes used for \u2018older adults\u2019 in the Japanese 
271
sometimes used for \u2018older adults\u2019 in the Japanese 
            
272
literature. Cases where the same values are reported for minimum and 
272
literature. Cases where the same values are reported for minimum and 
            
273
maximum individual ages represent average estimated age. Some of the 
273
maximum individual ages represent average estimated age. Some of the 
            
274
studies used here report very precise age estimates for sub-adults. In 
274
studies used here report very precise age estimates for sub-adults. In 
            
275
such cases our dataset follows these estimates, which are derived from 
275
such cases our dataset follows these estimates, which are derived from 
            
276
different methods described in the studies concerned.\r\n\r\nThe 
276
different methods described in the studies concerned.\r\n\r\nThe 
            
277
chronological range of the sample is given by a minimum age 
277
chronological range of the sample is given by a minimum age 
            
278
(Min_chronology age (95%)) and maximum age (Max_chronology age (95%)) 
278
(Min_chronology age (95%)) and maximum age (Max_chronology age (95%)) 
            
279
in years BC and AD with years BC expressed by negative numbers. Age 
279
in years BC and AD with years BC expressed by negative numbers. Age 
            
280
assignment followed a hierarchical approach. Whenever available we 
280
assignment followed a hierarchical approach. Whenever available we 
            
281
employed direct dates from samples (e.g. radiocarbon dates, in which 
281
employed direct dates from samples (e.g. radiocarbon dates, in which 
            
282
the calibrated 95% range is reported) or from coeval samples from the 
282
the calibrated 95% range is reported) or from coeval samples from the 
            
283
same archaeological context. If necessary, corrections for aquatic 
283
same archaeological context. If necessary, corrections for aquatic 
            
284
marine radiocarbon reservoir effects were applied on direct 
284
marine radiocarbon reservoir effects were applied on direct 
            
285
radiocarbon measurements of human bones (see below). A dataset field 
285
radiocarbon measurements of human bones (see below). A dataset field 
            
286
(Dietary_ model_selection) identifies the type of Bayesian model 
286
(Dietary_ model_selection) identifies the type of Bayesian model 
            
287
employed to estimate the dietary contributions from marine carbon.. If 
287
employed to estimate the dietary contributions from marine carbon.. If 
            
288
no secure dating was available from the sample context, we employed 
288
no secure dating was available from the sample context, we employed 
            
289
the site\u2019s chronology given usually in the archaeological report. 
289
the site\u2019s chronology given usually in the archaeological report. 
            
290
If this was also not available, we employed the full cultural range to 
290
If this was also not available, we employed the full cultural range to 
            
291
which the sample was assigned. A field was used to identify the type 
291
which the sample was assigned. A field was used to identify the type 
            
292
of employed dating method (Dating_ method). Also included were fields 
292
of employed dating method (Dating_ method). Also included were fields 
            
293
for uncalibrated direct radiocarbon dates on sample (14C), its 
293
for uncalibrated direct radiocarbon dates on sample (14C), its 
            
294
uncertainty (14C unc). Period tags are also used to provide 
294
uncertainty (14C unc). Period tags are also used to provide 
            
295
traditional chronological information (Period_ 
295
traditional chronological information (Period_ 
            
296
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta_ 13C_ coll) and 
296
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta_ 13C_ coll) and 
            
297
nitrogen (delta_ 15N_ coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
297
nitrogen (delta_ 15N_ coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
            
298
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
298
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
            
299
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
299
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
            
300
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
300
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
            
301
collagen yield for bone samples (Collagen_ yield).\r\n\r\nA reference 
301
collagen yield for bone samples (Collagen_ yield).\r\n\r\nA reference 
            
302
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
302
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
            
303
source publication or publications from where the data was collected 
303
source publication or publications from where the data was collected 
            
304
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
304
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
            
305
available (Link), a Digital object identifier as a persistent 
305
available (Link), a Digital object identifier as a persistent 
            
306
identifier DOI (DOI), and the publication date or dates (Publication_ 
306
identifier DOI (DOI), and the publication date or dates (Publication_ 
            
307
date). Macrons were not used for Japanese titles in the list.",
307
date). Macrons were not used for Japanese titles in the list.",
            
308
      "format": "CSV",
308
      "format": "CSV",
            
309
      "hash": "",
309
      "hash": "",
            
310
      "id": "75920f42-db23-4d72-b7c8-40a51355c859",
310
      "id": "75920f42-db23-4d72-b7c8-40a51355c859",
            
n
311
      "last_modified": "2021-05-31T16:39:38.000453",
n
311
      "last_modified": "2021-06-11T13:13:02.706983",
            
312
      "metadata_modified": "2021-05-31T16:39:38.030037",
312
      "metadata_modified": "2021-06-11T13:13:02.756681",
            
313
      "mimetype": "text/csv",
313
      "mimetype": "text/csv",
            
314
      "mimetype_inner": null,
314
      "mimetype_inner": null,
            
315
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
315
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
            
316
in Japan v. 2 (CSV)",
316
in Japan v. 2 (CSV)",
            
317
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
317
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
318
      "position": 2,
318
      "position": 2,
            
319
      "resource_type": null,
319
      "resource_type": null,
            
t
320
      "size": 800406,
t
320
      "size": 1608282,
            
321
      "state": "active",
321
      "state": "active",
            
322
      "url": 
322
      "url": 
            
323
0f42-db23-4d72-b7c8-40a51355c859/download/japan-human-si-data-v2.csv",
323
0f42-db23-4d72-b7c8-40a51355c859/download/japan-human-si-data-v2.csv",
            
324
      "url_type": "upload"
324
      "url_type": "upload"
            
325
    },
325
    },
            
326
    {
326
    {
            
327
      "cache_last_updated": null,
327
      "cache_last_updated": null,
            
328
      "cache_url": null,
328
      "cache_url": null,
            
329
      "created": "2021-05-31T16:52:19.795549",
329
      "created": "2021-05-31T16:52:19.795549",
            
330
      "description": "Dietary model 1 employed for dietary estimates 
330
      "description": "Dietary model 1 employed for dietary estimates 
            
331
of marine carbon contributions and radiocarbon marine reservoir effect 
331
of marine carbon contributions and radiocarbon marine reservoir effect 
            
332
corrections.",
332
corrections.",
            
333
      "format": ".RData",
333
      "format": ".RData",
            
334
      "hash": "",
334
      "hash": "",
            
335
      "id": "6b6148f5-660d-4aee-a47d-5cdf4d8a8479",
335
      "id": "6b6148f5-660d-4aee-a47d-5cdf4d8a8479",
            
336
      "last_modified": "2021-05-31T16:52:19.751264",
336
      "last_modified": "2021-05-31T16:52:19.751264",
            
337
      "metadata_modified": "2021-05-31T16:52:19.782031",
337
      "metadata_modified": "2021-05-31T16:52:19.782031",
            
338
      "mimetype": null,
338
      "mimetype": null,
            
339
      "mimetype_inner": null,
339
      "mimetype_inner": null,
            
340
      "name": "ReSources dietary model 1",
340
      "name": "ReSources dietary model 1",
            
341
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
341
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
342
      "position": 3,
342
      "position": 3,
            
343
      "resource_type": null,
343
      "resource_type": null,
            
344
      "size": 1877,
344
      "size": 1877,
            
345
      "state": "active",
345
      "state": "active",
            
346
      "url": 
346
      "url": 
            
347
resource/6b6148f5-660d-4aee-a47d-5cdf4d8a8479/download/model-1.rdata",
347
resource/6b6148f5-660d-4aee-a47d-5cdf4d8a8479/download/model-1.rdata",
            
348
      "url_type": "upload"
348
      "url_type": "upload"
            
349
    },
349
    },
            
350
    {
350
    {
            
351
      "cache_last_updated": null,
351
      "cache_last_updated": null,
            
352
      "cache_url": null,
352
      "cache_url": null,
            
353
      "created": "2021-05-31T16:53:38.996760",
353
      "created": "2021-05-31T16:53:38.996760",
            
354
      "description": "Dietary model 2 employed for dietary estimates 
354
      "description": "Dietary model 2 employed for dietary estimates 
            
355
of marine carbon contributions and radiocarbon marine reservoir effect 
355
of marine carbon contributions and radiocarbon marine reservoir effect 
            
356
corrections.",
356
corrections.",
            
357
      "format": ".RData",
357
      "format": ".RData",
            
358
      "hash": "",
358
      "hash": "",
            
359
      "id": "6f7ffed7-5eb7-4969-9608-e45af66f59fb",
359
      "id": "6f7ffed7-5eb7-4969-9608-e45af66f59fb",
            
360
      "last_modified": "2021-05-31T16:53:38.949200",
360
      "last_modified": "2021-05-31T16:53:38.949200",
            
361
      "metadata_modified": "2021-05-31T16:53:38.982671",
361
      "metadata_modified": "2021-05-31T16:53:38.982671",
            
362
      "mimetype": null,
362
      "mimetype": null,
            
363
      "mimetype_inner": null,
363
      "mimetype_inner": null,
            
364
      "name": "ReSources dietary model 2",
364
      "name": "ReSources dietary model 2",
            
365
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
365
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
366
      "position": 4,
366
      "position": 4,
            
367
      "resource_type": null,
367
      "resource_type": null,
            
368
      "size": 14219,
368
      "size": 14219,
            
369
      "state": "active",
369
      "state": "active",
            
370
      "url": 
370
      "url": 
            
371
resource/6f7ffed7-5eb7-4969-9608-e45af66f59fb/download/model-2.rdata",
371
resource/6f7ffed7-5eb7-4969-9608-e45af66f59fb/download/model-2.rdata",
            
372
      "url_type": "upload"
372
      "url_type": "upload"
            
373
    },
373
    },
            
374
    {
374
    {
            
375
      "cache_last_updated": null,
375
      "cache_last_updated": null,
            
376
      "cache_url": null,
376
      "cache_url": null,
            
377
      "created": "2021-05-31T16:54:33.712570",
377
      "created": "2021-05-31T16:54:33.712570",
            
378
      "description": "Dietary model 3 employed for dietary estimates 
378
      "description": "Dietary model 3 employed for dietary estimates 
            
379
of marine carbon contributions and radiocarbon marine reservoir effect 
379
of marine carbon contributions and radiocarbon marine reservoir effect 
            
380
corrections.\r\n",
380
corrections.\r\n",
            
381
      "format": ".RData",
381
      "format": ".RData",
            
382
      "hash": "",
382
      "hash": "",
            
383
      "id": "0b559302-6562-4a1e-a914-bab1188f1cca",
383
      "id": "0b559302-6562-4a1e-a914-bab1188f1cca",
            
384
      "last_modified": "2021-05-31T16:54:33.665862",
384
      "last_modified": "2021-05-31T16:54:33.665862",
            
385
      "metadata_modified": "2021-05-31T16:54:33.698389",
385
      "metadata_modified": "2021-05-31T16:54:33.698389",
            
386
      "mimetype": null,
386
      "mimetype": null,
            
387
      "mimetype_inner": null,
387
      "mimetype_inner": null,
            
388
      "name": "ReSources dietary model 1",
388
      "name": "ReSources dietary model 1",
            
389
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
389
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
390
      "position": 5,
390
      "position": 5,
            
391
      "resource_type": null,
391
      "resource_type": null,
            
392
      "size": 17526,
392
      "size": 17526,
            
393
      "state": "active",
393
      "state": "active",
            
394
      "url": 
394
      "url": 
            
395
resource/0b559302-6562-4a1e-a914-bab1188f1cca/download/model-3.rdata",
395
resource/0b559302-6562-4a1e-a914-bab1188f1cca/download/model-3.rdata",
            
396
      "url_type": "upload"
396
      "url_type": "upload"
            
397
    }
397
    }
            
398
  ],
398
  ],
            
399
  "state": "active",
399
  "state": "active",
            
400
  "tags": [
400
  "tags": [
            
401
    {
401
    {
            
402
      "display_name": "Archaeology",
402
      "display_name": "Archaeology",
            
403
      "id": "added2c9-60e3-4991-bea0-38241d803b73",
403
      "id": "added2c9-60e3-4991-bea0-38241d803b73",
            
404
      "name": "Archaeology",
404
      "name": "Archaeology",
            
405
      "state": "active",
405
      "state": "active",
            
406
      "vocabulary_id": null
406
      "vocabulary_id": null
            
407
    },
407
    },
            
408
    {
408
    {
            
409
      "display_name": "Database",
409
      "display_name": "Database",
            
410
      "id": "e36afad0-91c1-4df0-966e-8bdda7d5ffb0",
410
      "id": "e36afad0-91c1-4df0-966e-8bdda7d5ffb0",
            
411
      "name": "Database",
411
      "name": "Database",
            
412
      "state": "active",
412
      "state": "active",
            
413
      "vocabulary_id": null
413
      "vocabulary_id": null
            
414
    },
414
    },
            
415
    {
415
    {
            
416
      "display_name": "Diet",
416
      "display_name": "Diet",
            
417
      "id": "b0efb573-f810-4312-8b3b-38fb46804eef",
417
      "id": "b0efb573-f810-4312-8b3b-38fb46804eef",
            
418
      "name": "Diet",
418
      "name": "Diet",
            
419
      "state": "active",
419
      "state": "active",
            
420
      "vocabulary_id": null
420
      "vocabulary_id": null
            
421
    },
421
    },
            
422
    {
422
    {
            
423
      "display_name": "Japan",
423
      "display_name": "Japan",
            
424
      "id": "17fe52f9-59d3-434b-97f2-1289242442cc",
424
      "id": "17fe52f9-59d3-434b-97f2-1289242442cc",
            
425
      "name": "Japan",
425
      "name": "Japan",
            
426
      "state": "active",
426
      "state": "active",
            
427
      "vocabulary_id": null
427
      "vocabulary_id": null
            
428
    },
428
    },
            
429
    {
429
    {
            
430
      "display_name": "Stable isotopes",
430
      "display_name": "Stable isotopes",
            
431
      "id": "3519702f-70f2-4d36-acb2-9c02bb24c492",
431
      "id": "3519702f-70f2-4d36-acb2-9c02bb24c492",
            
432
      "name": "Stable isotopes",
432
      "name": "Stable isotopes",
            
433
      "state": "active",
433
      "state": "active",
            
434
      "vocabulary_id": null
434
      "vocabulary_id": null
            
435
    }
435
    }
            
436
  ],
436
  ],
            
437
  "temporal_end": "1868",
437
  "temporal_end": "1868",
            
438
  "temporal_start": "-20000",
438
  "temporal_start": "-20000",
            
439
  "title": "ARCHIPELAGO human stable isotope database",
439
  "title": "ARCHIPELAGO human stable isotope database",
            
440
  "type": "dataset",
440
  "type": "dataset",
            
441
  "url": null,
441
  "url": null,
            
442
  "version": ""
442
  "version": ""
            
443
}
443
}