Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Mark Hudson & Ricardo Fernandes",
2
  "author": "Mark Hudson & Ricardo Fernandes",
            
3
  "author_email": "hudson@shh.mpg.de",
3
  "author_email": "hudson@shh.mpg.de",
            
4
  "creator_user_id": "a529d3d6-d77a-4797-b965-a00f60123108",
4
  "creator_user_id": "a529d3d6-d77a-4797-b965-a00f60123108",
            
5
  "doi": "10.48493/jyvf-5a27",
5
  "doi": "10.48493/jyvf-5a27",
            
6
  "ext_doi": "",
6
  "ext_doi": "",
            
7
  "gen": [
7
  "gen": [
            
8
    "yes"
8
    "yes"
            
9
  ],
9
  ],
            
10
  "groups": [
10
  "groups": [
            
11
    {
11
    {
            
12
      "description": "The IsoMemo group list datasets created by 
12
      "description": "The IsoMemo group list datasets created by 
            
13
IsoMemo partners. Both those that are stored internally within Pandora 
13
IsoMemo partners. Both those that are stored internally within Pandora 
            
14
and those that are stored externally.",
14
and those that are stored externally.",
            
15
      "display_name": "IsoMemo group",
15
      "display_name": "IsoMemo group",
            
16
      "id": "1739bd12-4cd3-48eb-8658-c1d470d0f965",
16
      "id": "1739bd12-4cd3-48eb-8658-c1d470d0f965",
            
n
17
      "image_display_url": "",
n
17
      "image_display_url": 
            
18
s://pandoradata.earth/uploads/group/2021-03-30-175014.746487logo.jpg",
            
18
      "name": "isomemo-group",
19
      "name": "isomemo-group",
            
19
      "title": "IsoMemo group"
20
      "title": "IsoMemo group"
            
20
    }
21
    }
            
21
  ],
22
  ],
            
22
  "id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
23
  "id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
23
  "isopen": true,
24
  "isopen": true,
            
24
  "license_id": "cc-by-sa",
25
  "license_id": "cc-by-sa",
            
25
  "license_title": "Creative Commons Attribution Share-Alike",
26
  "license_title": "Creative Commons Attribution Share-Alike",
            
26
  "license_url": "http://www.opendefinition.org/licenses/cc-by-sa",
27
  "license_url": "http://www.opendefinition.org/licenses/cc-by-sa",
            
27
  "maintainer": "Mark Hudson",
28
  "maintainer": "Mark Hudson",
            
28
  "maintainer_email": "hudson@shh.mpg.de",
29
  "maintainer_email": "hudson@shh.mpg.de",
            
29
  "metadata_created": "2021-02-24T14:13:23.047617",
30
  "metadata_created": "2021-02-24T14:13:23.047617",
            
n
30
  "metadata_modified": "2021-02-25T12:00:37.018614",
n
31
  "metadata_modified": "2021-05-26T18:05:45.065733",
            
31
  "name": "archipelago-human-stable-isotope-database",
32
  "name": "archipelago-human-stable-isotope-database",
            
32
  "notes": "The dataset contains human bone and hair carbon and 
33
  "notes": "The dataset contains human bone and hair carbon and 
            
33
nitrogen stable isotopes measurements from Japanese archaeological 
34
nitrogen stable isotopes measurements from Japanese archaeological 
            
34
sites covering the time span from the Upper Palaeolithic to the 
35
sites covering the time span from the Upper Palaeolithic to the 
            
35
mid-nineteenth century. ",
36
mid-nineteenth century. ",
            
n
36
  "num_resources": 1,
n
37
  "num_resources": 2,
            
37
  "num_tags": 5,
38
  "num_tags": 5,
            
38
  "organization": {
39
  "organization": {
            
39
    "approval_status": "approved",
40
    "approval_status": "approved",
            
40
    "created": "2021-02-03T17:53:29.162864",
41
    "created": "2021-02-03T17:53:29.162864",
            
41
    "description": "ARCHIPELAGO is an integrated archaeological and 
42
    "description": "ARCHIPELAGO is an integrated archaeological and 
            
42
historical database of land and sea resources utilised by humans in 
43
historical database of land and sea resources utilised by humans in 
            
43
the Japanese Islands. ",
44
the Japanese Islands. ",
            
44
    "id": "bbef4dd3-7e14-4de7-925e-8b2343542130",
45
    "id": "bbef4dd3-7e14-4de7-925e-8b2343542130",
            
45
    "image_url": "2021-02-21-190437.479608logo.png",
46
    "image_url": "2021-02-21-190437.479608logo.png",
            
46
    "is_organization": true,
47
    "is_organization": true,
            
47
    "name": "archipelago",
48
    "name": "archipelago",
            
48
    "state": "active",
49
    "state": "active",
            
49
    "title": "ARCHIPELAGO",
50
    "title": "ARCHIPELAGO",
            
50
    "type": "organization"
51
    "type": "organization"
            
51
  },
52
  },
            
52
  "owner_org": "bbef4dd3-7e14-4de7-925e-8b2343542130",
53
  "owner_org": "bbef4dd3-7e14-4de7-925e-8b2343542130",
            
53
  "private": false,
54
  "private": false,
            
54
  "relationships_as_object": [],
55
  "relationships_as_object": [],
            
55
  "relationships_as_subject": [],
56
  "relationships_as_subject": [],
            
56
  "resources": [
57
  "resources": [
            
57
    {
58
    {
            
58
      "cache_last_updated": null,
59
      "cache_last_updated": null,
            
59
      "cache_url": null,
60
      "cache_url": null,
            
60
      "created": "2021-02-24T22:09:19.603156",
61
      "created": "2021-02-24T22:09:19.603156",
            
61
      "description": "The data table consists of fields organized into 
62
      "description": "The data table consists of fields organized into 
            
62
thematic groups. Each data entry is identified by a unique sequential 
63
thematic groups. Each data entry is identified by a unique sequential 
            
63
key (Entry ID). The data submitter may include additional comments not 
64
key (Entry ID). The data submitter may include additional comments not 
            
64
covered by the existing fields (Comments), and identify the data 
65
covered by the existing fields (Comments), and identify the data 
            
65
submitter (ID submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample 
66
submitter (ID submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample 
            
66
context are described in several fields. A site name (Site name), 
67
context are described in several fields. A site name (Site name), 
            
67
short site description (Site description), short description of burial 
68
short site description (Site description), short description of burial 
            
68
context (Context description), a context identifier as given in 
69
context (Context description), a context identifier as given in 
            
69
publication (Context ID), the name of the locality at which the site 
70
publication (Context ID), the name of the locality at which the site 
            
70
is located (Locality), of the corresponding region (Region), the site 
71
is located (Locality), of the corresponding region (Region), the site 
            
71
altitude in meters (Altitude), latitude (Latitude) and longitude 
72
altitude in meters (Altitude), latitude (Latitude) and longitude 
            
72
(Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether the location 
73
(Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether the location 
            
73
of a site could not be exactly established (Exact) and if not the 
74
of a site could not be exactly established (Exact) and if not the 
            
74
range in kilometres within it is expected to be located relative to 
75
range in kilometres within it is expected to be located relative to 
            
75
the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological individual 
76
the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological individual 
            
76
from which the sample was taken is identified using the identification 
77
from which the sample was taken is identified using the identification 
            
77
provided in the original publication (Individual ID) followed by a 
78
provided in the original publication (Individual ID) followed by a 
            
78
short description of the burial (Burial type). Additional sample 
79
short description of the burial (Burial type). Additional sample 
            
79
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
80
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
            
80
common language (Taxon common name). Our database currently contains 
81
common language (Taxon common name). Our database currently contains 
            
81
only human data but in the future we plan to expand it to include 
82
only human data but in the future we plan to expand it to include 
            
82
other taxa. Osteological information includes sex identification 
83
other taxa. Osteological information includes sex identification 
            
83
(Sex), a text description of age (Age category individual), numeric 
84
(Sex), a text description of age (Age category individual), numeric 
            
84
ranges in years for minimum (Min. age individual) and maximum age 
85
ranges in years for minimum (Min. age individual) and maximum age 
            
85
(Max. age individual), and the type of bone or hair material that 
86
(Max. age individual), and the type of bone or hair material that 
            
86
sampled from the archaeological individual (sample type).\r\n\r\nThe 
87
sampled from the archaeological individual (sample type).\r\n\r\nThe 
            
87
chronological range of the sample is given by a minimum age (Min age 
88
chronological range of the sample is given by a minimum age (Min age 
            
88
(95%)) and maximum age (Max age (95%)) in years BC and AD with years 
89
(95%)) and maximum age (Max age (95%)) in years BC and AD with years 
            
89
BC expressed by negative numbers. Age assignment followed a 
90
BC expressed by negative numbers. Age assignment followed a 
            
90
hierarchical approach. Whenever available we employed direct dates 
91
hierarchical approach. Whenever available we employed direct dates 
            
91
from samples (e.g. radiocarbon dates, in which the calibrated 95% 
92
from samples (e.g. radiocarbon dates, in which the calibrated 95% 
            
92
range is reported) or from coeval samples from the same archaeological 
93
range is reported) or from coeval samples from the same archaeological 
            
93
context. If necessary, corrections for aquatic radiocarbon reservoir 
94
context. If necessary, corrections for aquatic radiocarbon reservoir 
            
94
effects were applied. If no secure dating was available from the 
95
effects were applied. If no secure dating was available from the 
            
95
sample context, we employed the site\u2019s chronology given usually 
96
sample context, we employed the site\u2019s chronology given usually 
            
96
in the archaeological report. If this was also not available, we 
97
in the archaeological report. If this was also not available, we 
            
97
employed the full cultural range to which the sample was assigned. A 
98
employed the full cultural range to which the sample was assigned. A 
            
98
field was used to identify the type of employed dating method (Dating 
99
field was used to identify the type of employed dating method (Dating 
            
99
method). Also included were fields for uncalibrated direct radiocarbon 
100
method). Also included were fields for uncalibrated direct radiocarbon 
            
100
dates on sample (14C), its uncertainty (14C unc). Period tags are also 
101
dates on sample (14C), its uncertainty (14C unc). Period tags are also 
            
101
used to provide traditional chronological information (Period 
102
used to provide traditional chronological information (Period 
            
102
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta 13C coll) and 
103
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta 13C coll) and 
            
103
nitrogen (delta 15N coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
104
nitrogen (delta 15N coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
            
104
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
105
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
            
105
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
106
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
            
106
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
107
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
            
107
collagen yield for bone samples (Collagen yield).\r\n\r\nA reference 
108
collagen yield for bone samples (Collagen yield).\r\n\r\nA reference 
            
108
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
109
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
            
109
source publication or publications from where the data was collected 
110
source publication or publications from where the data was collected 
            
110
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
111
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
            
111
available (Link), a DOI (DOI), and the publication date or dates 
112
available (Link), a DOI (DOI), and the publication date or dates 
            
112
(Publication date). Macrons were not used for Japanese titles in the 
113
(Publication date). Macrons were not used for Japanese titles in the 
            
113
list.\r\n",
114
list.\r\n",
            
114
      "format": "CSV",
115
      "format": "CSV",
            
115
      "hash": "",
116
      "hash": "",
            
116
      "id": "971c397a-1806-4b59-97e1-0915dab25428",
117
      "id": "971c397a-1806-4b59-97e1-0915dab25428",
            
117
      "last_modified": "2021-02-25T12:00:37.011370",
118
      "last_modified": "2021-02-25T12:00:37.011370",
            
118
      "metadata_modified": "2021-02-25T12:00:37.022584",
119
      "metadata_modified": "2021-02-25T12:00:37.022584",
            
119
      "mimetype": "text/csv",
120
      "mimetype": "text/csv",
            
120
      "mimetype_inner": null,
121
      "mimetype_inner": null,
            
121
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
122
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
            
122
in Japan",
123
in Japan",
            
123
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
124
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
124
      "position": 0,
125
      "position": 0,
            
125
      "resource_type": null,
126
      "resource_type": null,
            
126
      "size": 799850,
127
      "size": 799850,
            
127
      "state": "active",
128
      "state": "active",
            
128
      "url": 
129
      "url": 
            
129
71c397a-1806-4b59-97e1-0915dab25428/download/japan-human-si-data.csv",
130
71c397a-1806-4b59-97e1-0915dab25428/download/japan-human-si-data.csv",
            
130
      "url_type": "upload"
131
      "url_type": "upload"
            
t
t
132
    },
            
133
    {
            
134
      "cache_last_updated": null,
            
135
      "cache_url": null,
            
136
      "created": "2021-05-26T18:05:45.096083",
            
137
      "description": "Version 2 of database for stable isotope 
            
138
measurements for archaeological humans in Japan\r\n\r\nThe data table 
            
139
consists of fields organized into thematic groups. Each data entry is 
            
140
identified by a unique sequential key (Entry_ ID). The data submitter 
            
141
may include additional comments not covered by the existing fields 
            
142
(Comments), and identify the data submitter by name (ID_ 
            
143
submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample context are 
            
144
described in several fields. A site name (Site name), short site 
            
145
description of the type of site (Site_ description), short description 
            
146
of burial context (Context description), a context identifier as given 
            
147
in original publication (Context_ ID), the name of the locality at 
            
148
which the site is located (Locality), of the corresponding region 
            
149
(Region), the site altitude in meteres (Altitude), latitude (Latitude) 
            
150
and longitude (Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether 
            
151
the location of a site could not be exactly established (Exact) and if 
            
152
not the range in kilometres within it is expected to be located 
            
153
relative to the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological 
            
154
individual from which the sample was taken is identified using the 
            
155
identification provided in the original publication (Individual ID) 
            
156
followed by a short description of the burial 
            
157
(Burial_type_skeletal_context Burial type). Additional sample 
            
158
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
            
159
common language (Taxon common name). Our database dataset currently 
            
160
contains only human data but in the future we plan to expand it to 
            
161
include other taxa. Osteological information includes sex 
            
162
identification (Sex), a text description of age (Age_ category_ 
            
163
individual), numeric ranges in years for minimum (Min_. age_ 
            
164
individual) and maximum age (Max_. age_ individual) biological age of 
            
165
the individual at death, and the type of bone or hair material that 
            
166
sampled from the archaeological individual (Ssample_ 
            
167
type).\r\n\r\nBiological age categories for skeletal individuals 
            
168
followed the published reports. These reports used standard 
            
169
bioarchaeological categories based on dental and skeletal age [24]: 
            
170
infant: birth \u2013 3 years; child: 3- 12 years; adolescent: 12-20 
            
171
years; young adult: 20-35 years; middle adult: 35-50 years; old adult: 
            
172
50 + years. In some cases, particularly with older publications, the 
            
173
ages of these categories may differ slightly. The age > 55 is 
            
174
sometimes used for \u2018older adults\u2019 in the Japanese 
            
175
literature. Cases where the same values are reported for minimum and 
            
176
maximum individual ages represent average estimated age. Some of the 
            
177
studies used here report very precise age estimates for sub-adults. In 
            
178
such cases our dataset follows these estimates, which are derived from 
            
179
different methods described in the studies concerned.\r\n\r\nThe 
            
180
chronological range of the sample is given by a minimum age 
            
181
(Min_chronology age (95%)) and maximum age (Max_chronology age (95%)) 
            
182
in years BC and AD with years BC expressed by negative numbers. Age 
            
183
assignment followed a hierarchical approach. Whenever available we 
            
184
employed direct dates from samples (e.g. radiocarbon dates, in which 
            
185
the calibrated 95% range is reported) or from coeval samples from the 
            
186
same archaeological context. If necessary, corrections for aquatic 
            
187
marine radiocarbon reservoir effects were applied on direct 
            
188
radiocarbon measurements of human bones (see below). A dataset field 
            
189
(Dietary_ model_selection) identifies the type of Bayesian model 
            
190
employed to estimate the dietary contributions from marine carbon.. If 
            
191
no secure dating was available from the sample context, we employed 
            
192
the site\u2019s chronology given usually in the archaeological report. 
            
193
If this was also not available, we employed the full cultural range to 
            
194
which the sample was assigned. A field was used to identify the type 
            
195
of employed dating method (Dating_ method). Also included were fields 
            
196
for uncalibrated direct radiocarbon dates on sample (14C), its 
            
197
uncertainty (14C unc). Period tags are also used to provide 
            
198
traditional chronological information (Period_ 
            
199
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta_ 13C_ coll) and 
            
200
nitrogen (delta_ 15N_ coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
            
201
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
            
202
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
            
203
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
            
204
collagen yield for bone samples (Collagen_ yield).\r\n\r\nA reference 
            
205
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
            
206
source publication or publications from where the data was collected 
            
207
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
            
208
available (Link), a Digital object identifier as a persistent 
            
209
identifier DOI (DOI), and the publication date or dates (Publication_ 
            
210
date). Macrons were not used for Japanese titles in the list.",
            
211
      "format": "XLSX",
            
212
      "hash": "",
            
213
      "id": "b147d214-b60f-4bb4-af6c-5bde3eefffeb",
            
214
      "last_modified": "2021-05-26T18:05:45.042633",
            
215
      "metadata_modified": "2021-05-26T18:05:45.075806",
            
216
      "mimetype": 
            
217
"application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet",
            
218
      "mimetype_inner": null,
            
219
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
            
220
in Japan v. 2",
            
221
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
222
      "position": 1,
            
223
      "resource_type": null,
            
224
      "size": 280177,
            
225
      "state": "active",
            
226
      "url": 
            
227
214-b60f-4bb4-af6c-5bde3eefffeb/download/japan-human-si-data-v2.xlsx",
            
228
      "url_type": "upload"
            
131
    }
229
    }
            
132
  ],
230
  ],
            
133
  "state": "active",
231
  "state": "active",
            
134
  "tags": [
232
  "tags": [
            
135
    {
233
    {
            
136
      "display_name": "Archaeology",
234
      "display_name": "Archaeology",
            
137
      "id": "added2c9-60e3-4991-bea0-38241d803b73",
235
      "id": "added2c9-60e3-4991-bea0-38241d803b73",
            
138
      "name": "Archaeology",
236
      "name": "Archaeology",
            
139
      "state": "active",
237
      "state": "active",
            
140
      "vocabulary_id": null
238
      "vocabulary_id": null
            
141
    },
239
    },
            
142
    {
240
    {
            
143
      "display_name": "Database",
241
      "display_name": "Database",
            
144
      "id": "e36afad0-91c1-4df0-966e-8bdda7d5ffb0",
242
      "id": "e36afad0-91c1-4df0-966e-8bdda7d5ffb0",
            
145
      "name": "Database",
243
      "name": "Database",
            
146
      "state": "active",
244
      "state": "active",
            
147
      "vocabulary_id": null
245
      "vocabulary_id": null
            
148
    },
246
    },
            
149
    {
247
    {
            
150
      "display_name": "Diet",
248
      "display_name": "Diet",
            
151
      "id": "b0efb573-f810-4312-8b3b-38fb46804eef",
249
      "id": "b0efb573-f810-4312-8b3b-38fb46804eef",
            
152
      "name": "Diet",
250
      "name": "Diet",
            
153
      "state": "active",
251
      "state": "active",
            
154
      "vocabulary_id": null
252
      "vocabulary_id": null
            
155
    },
253
    },
            
156
    {
254
    {
            
157
      "display_name": "Japan",
255
      "display_name": "Japan",
            
158
      "id": "17fe52f9-59d3-434b-97f2-1289242442cc",
256
      "id": "17fe52f9-59d3-434b-97f2-1289242442cc",
            
159
      "name": "Japan",
257
      "name": "Japan",
            
160
      "state": "active",
258
      "state": "active",
            
161
      "vocabulary_id": null
259
      "vocabulary_id": null
            
162
    },
260
    },
            
163
    {
261
    {
            
164
      "display_name": "Stable isotopes",
262
      "display_name": "Stable isotopes",
            
165
      "id": "3519702f-70f2-4d36-acb2-9c02bb24c492",
263
      "id": "3519702f-70f2-4d36-acb2-9c02bb24c492",
            
166
      "name": "Stable isotopes",
264
      "name": "Stable isotopes",
            
167
      "state": "active",
265
      "state": "active",
            
168
      "vocabulary_id": null
266
      "vocabulary_id": null
            
169
    }
267
    }
            
170
  ],
268
  ],
            
171
  "temporal_end": "1868",
269
  "temporal_end": "1868",
            
172
  "temporal_start": "-20000",
270
  "temporal_start": "-20000",
            
173
  "title": "ARCHIPELAGO human stable isotope database",
271
  "title": "ARCHIPELAGO human stable isotope database",
            
174
  "type": "dataset",
272
  "type": "dataset",
            
175
  "url": null,
273
  "url": null,
            
176
  "version": ""
274
  "version": ""
            
177
}
275
}